EpiNext™ Post-Bisulfite DNA 文库制备试剂盒是一整套优化的试剂,用于在亚硫酸氢盐成功转化后制备 DNA 文库,用于各种基于 Illumina 平台的亚硫酸氢盐测序 (bisulfite-seq) 分析,例如全基因组亚硫酸氢盐测序 (WGBS)、氧化亚硫酸氢盐测序 (oxBs-seq)、还原代表性亚硫酸氢盐测序 (RRBS) 和其他基于亚硫酸氢盐的下一代测序应用。该试剂盒的优化方案和组分允许使用亚纳克起始浓度的 DNA 快速构建非条形码(单重)和条形码(多重)DNA 文库,因为 DNA 首先被亚硫酸氢盐转化,然后用于文库制备。该套件具有以下优点和特点:
背景信息 目前有几种方法,包括全基因组亚硫酸氢盐测序 (WGBS) 和亚硫酸氢盐低表达测序 (RRBS),用于全基因组 DNA 甲烷化分析。这些方法将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶,而 5-甲基胞嘧啶在亚硫酸氢盐处理下保持不变。这使得表观遗传差异成为遗传差异,随后可以通过基于单一分辨率水平和全基因组尺度的测序来检测。然而,目前这种方法的实际应用并不理想,因为它们 (1) 需要大量的 DNA (>1 μg) 作为输入材料,这很难从有限的生物样品(如肿瘤活检、早期 embyros、embyronic 组织和循环 DNA)中制备;(2) 需要先剪切 DNA,然后连接到接头上,然后进行亚硫酸氢盐转化(连接后亚硫酸氢盐转化),这会导致接头 DNA 片段构建体中的大量 DNA 片段断裂,从而形成单标签模板,这些模板在文库富集过程中被去除;(3) 耗时 (2 天)。EpiNext Post-Bisulfite DNA 文库制备试剂盒旨在克服这些弱点。
原理和程序 使用此试剂盒,亚硫酸氢盐处理的DNA(为单链形式)被转化为双链DNA,并直接用于与扩增和测序所必需的BisDNA特异性适配器进行连接。然后对片段进行大小选择,并使用 MQ 微珠进行纯化,从而可以快速、**地选择 DNA 大小。然后用高保真 PCR 混合物扩增大小选择的 DNA 片段,确保以*少的起始材料获得*大产量,并以低错误率和*小偏差提供高度准确的文库 DNA 扩增。
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